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Breed Discrimination Using DNA Markers Derived from AFLP in Japanese Beef Cattle
AFLP Breed Discrimination Beef Cattle Japanese Black Holstein
2016/4/21
In the meat industry, correct breed information in food labeling is required to assure meat quality. Genetic markers provide corroborating evidence to identify breed. This paper describes the developm...
棉纤维强度主要由棉纤维次生壁加厚期决定. 以陆地棉品种中棉所8号和海岛棉品种Pima90-53建立的包含109个单株的种间杂交F2群体为材料, 用cDNA-AFLP对棉纤维发育次生壁加厚期(20~25 DPA)基因表达谱进行剖析, 并构建了次生壁加厚期转录组图谱. 37对AFLP引物组合共检测到138个多态性表达片段(transcript-derived fragments, TDFs), 大小在...
38株维氏气单胞菌分离株的AFLP基因分型研究
维氏气单胞菌 DNA扩增片段长度多态性 基因分型 指纹图谱 聚类分析
2013/10/16
试验通过人工设计合成的通用接头以及与接头序列相匹配的专用引物,对38株维氏气单胞菌分离株和1株维氏气单胞菌标准菌株进行AFLP基因分型研究。结果显示,采用5对引物使39株维氏气单胞菌扩增出1080条可见条带,片段长度在50-1000 bp之间, 其中多态性条带727条, 平均每对引物组合产生154条多态性条带, 平均多态性检出率为66.7%。按UPGMA方法对条带进行聚类分析,建立聚类分支树状图,...
新生隐球菌的AFLP分析
新生隐球菌 DNA 扩增片段长度多态性
2012/8/10
目的 评估AFLP-DNA指纹技术在新生隐球菌分类中应用情况。方法 新生隐球菌基因组DNA用双酶酶切,双链接头连于其酶切末端,用与接头和酶切位点互补的引物扩增DNA片段,其产物在高分辨的变性聚丙酰胺凝胶上电泳分离,然后进行银染。结果 分析来自5种血清型和临床分离株的18株新生隐球菌,可见有30多条大小在30～500bp的DNA-AFLP指纹,相同的血清型有不同的指纹图谱,来自同一患者不同病期的两株...
本研究采用空间自相关分析方法对水杉(Metasequoia glyptostroboides)孑遗居群AFLP遗传变异的空间结构进行了研究，以探讨水杉孑遗居群遗传变异的分布特征及其形成机制。根据6对AFLP选择性引物扩增的46个多态性位点，选择了其表型频率在25%～75%的27个AFLP标记，运用等样本频率方法和等地理距离间隔方法分别对39株和37株原生母树进行了空间自相关系数Moran‘s I值...
斑鳜不同地理群体遗传变异的AFLP分析
斑鳜
2009/8/26
斑鳜（Siniperca scherzeri Steindachner）为东亚地区特有的淡水名贵经济鱼类。受生态环境破坏和渔业捕捞过度的影响，斑鳜野生资源已呈下降趋势。为探明我国斑鳜不同地理群体的遗传背景，采用AFLP分子标记技术研究了鸭绿江、海河、长江、钱塘江、闽江、西江6个地理群体的遗传特征和群体分化。斑鳜65尾个体中，8对引物组合共扩增出211条带，其中多态性条带126条，多态比例为59.7...
长臀鮠的AFLP分析
长臀鮠
2009/8/26
采用 AFLP分子标记技术对珠江长臀鮠和海南长臀鮠共60个个体(每个群体30个)进行了遗传多样性研究。选取的18对引物组合均能扩增出清晰、可重复的扩增产物，扩增带型差异明显。两个群体均表现出较高的多态位点比例和特异性条带数。群体内个体间的遗传相似度(平均值)珠江长臀鮠种群为0.9462±0.0237, 海南长臀鮠为0.9465±0.0226，海南长臀鮠比珠江长臀鮠略高。群体间的遗传相似度是0.93...
真正柑橘果树类植物基于AFLP分子标记的分类与进化研究
AFLP 进化 谱系关系 真正柑桔果树类
2009/8/4
用AFLP分子标记技术对芸香科Rutaceae柑橘亚科Aurantioideae真正柑橘果树类(the True Citrus Fruit Trees Group) 6属植物的59个生物类型以及九里香Murraya exotica L.、蚝壳刺Severinia buxifolia Tenore和酒饼簕Atalantia buxifolia Oliv.进行了分析。从64对引物组合中筛选出15对分辨...
斑鳜不同地理群体遗传变异的AFLP分析
斑鳜 群体 遗传变异 AFLP
2009/6/3
斑鳜（Siniperca scherzeri Steindachner）为东亚地区特有的淡水名贵经济鱼类。受生态环境破坏和渔业捕捞过度的影响，斑鳜野生资源已呈下降趋势。为探明我国斑鳜不同地理群体的遗传背景，采用AFLP分子标记技术研究了鸭绿江、海河、长江、钱塘江、闽江、西江6个地理群体的遗传特征和群体分化。斑鳜65尾个体中，8对引物组合共扩增出211条带，其中多态性条带126条，多态比例为59.7...
用AFLP方法对灰背栎(Quercus senescens)8个居群进行了遗传多样性、居群遗传结构研究。TFPGA软件分析两组引物组合共产生125个位点，其中94个为多态位点，多态位点百分率为752%,发现灰背栎居群的遗传变异水平有随着海拔升高而遗传多样性下降的趋势。Arliquin 2000中的AMOVA分析表明灰背栎居群间分化大，分化指数达φst=02956。用PAUP软件对所有个体间的...
人工三倍体新桑品种嘉陵20号的AFLP分析
桑树 人工三倍体
2009/3/31
利用AFLP分子标记技术,从DNA水平对人工三倍体新桑品种嘉陵20号(2n=3x=42)及其亲本以及与嘉陵20号同亲本的2个三倍体(2n=3x=42)桑树材料与10个二倍体(2n=2x=28)桑树材料进行了遗传背景分析。获得了它们的指纹图谱、遗传距离及遗传相似系数，并绘制出了它们的UPGMA聚类图。研究结果发现：嘉陵20号的母本7920(2x；♀)与父本西庆四号(4x；♂)间的相似系数为0661...
应用AFLP 技术探讨半夏属五个种的亲缘关系
半夏属 AFLP 亲缘关系FONT
2009/2/6
利用扩增酶切片断多态性(AFLP) 方法研究半夏属内5 个种之间的亲缘关系。应用POPGENE 及SPSS 软件对所得“1”、“0”二元矩阵进行遗传距离, 遗传相似性及聚类分析。实验发现鹞落坪半夏与虎掌之间的遗传差异小, 鹞落坪半夏可能是虎掌的一个特化分支群体; 虎掌和鹞落坪半夏组与本属其他种之间遗传差异较大, 相似性较小; 盾叶半夏和滴水珠是姐妹群关系, 盾叶半夏虽然叶形与同属其他种有显著差异,...
品种的准确鉴定及其遗传相关性的了解对杨树育种和品种管理具有非常重要的意义。本试验采用AFLP对来自青杨组和黑杨组的21 个重要杨树品种( 无性系) 的鉴定与遗传相关性进行了研究。结果显示, 筛选的4对AFLP 引物总共产生了181 条多态性带, 尤其是每对引物对每个品种都产生了独特的指纹图谱; 聚类分析和多维尺度分析将试验材料大体上分为五类, 结果不仅显示了组间不同品种的差异, 而且大体上区分了我...