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国家自然科学基金委员会湖大彭绍亮课题组在AI辅助DNA-蛋白质相互作用研究方面取得进展（图）
蛋白质 人工智能 模型
2024/11/16
2024年9月13日，湖南大学信息科学与工程学院彭绍亮教授课题组在国际顶级期刊Nature Communications发表了题为Improving prediction performance of general protein language model by domain-adaptive pretraining on DNA-binding protein的研究论文。该研究提出了基于大...
中国农业科学院深圳农业基因组所提出DNA数字存储纠错新技术（图）
软件 基因 数据
2024/8/19
2023年9月2日，基因组所阮珏课题组和潘玮华课题组在《国家科学评论（National Science Review）》期刊上发表了题为“Improving Error-correcting Capability in DNA Digital Storage via Soft-decision Decoding”的研究论文，该研究首次利用构建的DNA数字存储中的精确错误模型融入纠错码解码，实现了D...
生物遗传信息的精确传递对生命的繁衍和进化至关重要。高等真核生物DNA复制需要确保亲代DNA包含的遗传信息准确传递给子代，且复制起始位点的正确选择是其中的重要环节。最新研究表明，在多细胞动物中含组蛋白变体H2A.Z的核小体通过结合组蛋白赖氨酸甲基转移酶SUV420H1促进组蛋白H4第20位赖氨酸的二甲基化（H4K20me2）的富集，并招募起始识别复合物完成复制起始位点的选择。
浙江大学生命科学研究院2021年6月7日黄俊实验室在Molecular Cell合作发表论文解析了BRCA1-BARD1复合物识别DNA损伤位点的分子结构基础（图）
黄俊 复合物识别 DNA损伤 分子结构
2022/10/26
2021年6月7日，浙江大学生命科学研究院黄俊实验室和中科院生物物理所周政实验室合作在Molecular Cell杂志在线发表了题为“Structural insight into BRCA1-BARD1 complex recruitment to damaged chromatin”的研究论文，揭示了乳腺癌易感基因产物BRCA1-BARD1异源二聚体被招募到DNA双链断裂损伤（DNA doub...
DNA存储技术座谈研讨会在京召开（图）
DNA 存储技术 座谈研讨会 京
2020/1/7
近日，由中国科协委托中国遗传学会主办、中国科学院北京基因组所承办的“DNA存储技术”座谈研讨会在京召开。全国十几家高等院校、科研院所和相关企业的20余位本领域专家学者出席了会议。DNA存储技术是一种新兴的大数据存储技术，利用人工合成特定序列DNA实现数据编码存储和读取。相比于现有的数据信息存储方式，DNA存储技术具有数据密度高、保存时间长、配套设备能耗低、便于携带、运输隐蔽性高和便于多重加密等技术...
DNA数据存储新法问世（图）
DNA 数据存储 新方法
2017/3/9
研究人员创建了一种在DNA中存储数据的新方法。人类正面临着一个数据存储的问题——全世界在过去两年中产生的数据比之前的数据总和还要多，并且这种信息迸发的趋势很快就将超过硬盘能够承载的能力。如今，研究人员报告说，他们想出了一种新的方式将数据编码进脱氧核糖核酸（DNA），从而创造出迄今最高密度大规模数据存储方案。
数据首次存入DNA内并可无损读取（图）
存入DNA 无损读取
2016/4/12
据美国华盛顿大学（UW）官网消息，来自该校和微软的科学家在DNA储存数据方面的研究更进了一步：他们通过将1和0编码转换成腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶这四种构成DNA的核苷酸序列，把图片和视频成功储存在DNA片段中，并实现了数据的无损读取，最新研究或将彻底变革计算机存储方式。
UW team stores digital images in DNA—and retrieves them perfectly
UW team stores digital images DNA retrieves them
2016/4/13
Technology companies routinely buildsprawling data centers to store all the baby pictures, financial transactions, funny cat videos and email messages its users hoard.But a new technique develope...
DNA Computation Based Approach for Enhanced Computing Power
DNA Computation Computing Power Evolutionary Computing
2015/7/22
DNA computing is a discipline that aims at harnessing individual molecules at the nano-scopic level for computational purposes. Computation with DNA molecules possesses an inherent interest for resear...
Getting the most from a surname study:semantics,DNA and computer modelling (third edition)
surnames DNA semantics modelling onomastics
2015/6/10
We here address such questions as: what does a surname mean;is it single origin;and,why do some surnames grow abnormally large? Though most surnames are rare, most people have populous surnames. In th...
在非线性函数下的DNA概率测量聚类分布
DNA聚类 概率值 非线性函数 基因组序列
2014/6/20
典型的聚类分析方法可将相似度较高的数据片段依据测量的数值特征聚集在一起，利用空间分布展示序列中存在相同或者不同的片段。本文针对不同来源的DAN序列，利用分组概率值的统计特征进行计算，采用三种非线性函数获得测量的投影测度，得到对应的基因测量特征形成可视化的聚类分布。比较结果显示，同类基因处理结果分层趋势相同，基因子序列分布图示在更高层次呈现出互补结构，而不同种类基因序列之间存在明显的分布差异。
提出一种高通量DNA序列数据的压缩算法.该算法先采用码书索引变换模型,将传统码书索引值的表示方法变换成由四个标准碱基字符替代的四进制数值方式,并采用一种界定替换串与非替换串的简明编码方法,接着通过信息熵的大小来决定是否进行块排序压缩变换(BWT),最后进行前移编码变换和Huffman熵编码.在多种测序数据集上的实验结果表明,CITD在大多数情况下可以获得比本文所对比的高通量DNA专用压缩方法更优的...
DNA纳米颗粒共聚体在图的连通度问题中的应用
DNA计算 DNA纳米金颗粒 图的连通度 三维模型
2016/12/27
本文提出了一种利用DNA纳米金颗粒共聚体的自组装过程解决图论中一个NP完全问题-连通度问题的DNA计算方法,构建了解决图的连通度问题的三维DNA自组装计算模型.根据设计的算法,首先需要根据具体的图的连通度问题设计用于自组装的DNA纳米金颗粒共聚体,然后根据算法经过一系列实验设计来求解连通度问题.本文利用Visual DSD仿真该实验的可行性,为下一步DNA自组装计算模型的应用提供了可行的方案.
DNA密码序列分组测量可视化模型
DNA序列 分组测量 共轭图
2014/6/20
随机序列生成和检测在密码学应用中发挥着重要作用，随着人类基因组计划的成功实施，应用随机序列检测工具处理DNA序列具有特殊意义。利用DNA序列本身具有的天然随机性，本文用共轭测量图示方法，提出了一种展现DNA序列测量特征空间分布的可视化模型，该模型能为深入解析DNA序列随机性测量特征的可视化研究提供参考。
Enhanced Self-Organizing Map Neural Network for DNA Sequence Classification
Bioinformatics Artificial Neural Networks Self-Organizing Map Classification Sequence Alignment
2013/1/28
The artificial neural networks (ANNs), among different soft computing methodologies are widely used to meet the challenges thrown by the main objectives of data mining classification techniques, due t...