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基于SSR标记的不同优势等级云南松遗传多样性分析
优势等级 遗传多样性 云南松
2019/5/27
基于SSR分子标记技术,按树高和胸径(地径)因子将样地内的植株分为优势木、中等木和劣势木3类,对不同生长优势等级云南松林木的遗传多样性变异特征进行了研究。结果表明:在林冠层,优势木的有效等位基因数、Shannon's信息指数、观测杂合度和期望杂合度分别为2.083、0.762、0.290和0.423,略高于中等木和劣势木;在更新层,有效等位基因数、Shannon's信息指数、观测杂合度和期望杂合度...
利用RAPD和SSR分子标记结合拟测交策略,对中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)“黄海1号”雌虾与野生雄虾作为亲本进行单对杂交产生的F1代,采用RAPD和SSR 两种分子标记技术初步构建了中国对虾雌、雄遗传连锁图谱。对460个RAPD引物和44对SSR引物进行筛选,共选出61个RAPD引物和20对SSR引物,用于对父母本和82个F1个体进行遗传分析。共得到母本分离标记14...
利用45对微卫星分子标记(SSR),以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)自然群体为实验材料,探讨野生群体遗传多样性研究中所需的最适样本量与标记量。实验设置6个样本量梯度,9个标记量梯度。对等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观察杂合度(Ho)、期望杂合度(He)等遗传多样性指标的变化趋势进行统计分析。结果表明,样本量、微卫星标记的数量和多态性水平对群体遗传多样性均有...
Multiple banding pattern,a potential problem of cross—species microsatellite amplilification,happened when EST-SSR
primers of Porphyra yezoensis were used in microsatellite amplification for several ...
柑橘EST-SSR分子标记分析
柑橘 EST 微卫星 SSR
2008/2/8
摘要对来源于甜橙(CitrussinensisOsbeck)、枳壳(PoncirustrifoliataRaf.)和其他柑橘非冗余EST数据库的38124条单一基因(Unigene)序列进行了简单重复序列SSRs(SimpleSequenceRepeat)搜索,所分析的柑橘非冗余核酸序列总长23.29Mb,从中获得了8218条SSR,其中包括单碱基重复4913条(59.8%),2碱基重复1419条...
摘要采用Genomic-SSR和EST-SSR标记技术,对来自我国北方冬麦区的18份普通小麦品种(系)的遗传多样性进行了探讨,并与系谱遗传距离进行了比较分析。研究发现,平均每个Genomic-SSR检测到的等位基因数为3.34个,明显高于EST-SSR的2.31个。遗传距离(GD)计算结果显示,18个小麦基因型之间的EST-SSR平均遗传距离较小,仅为0.3996,低于Genomic-SSR的GD...
玉米P25自交系抗锈病基因的遗传分析及SSR分子标记定位
玉米 南方型锈病 主基因-多基因混合模型 SSR 定位
2008/2/1
摘要 摘要:以玉米南方型锈病免疫自交系P25和感病自交系F349及F1、F2、B1和B2为材料,采用主基因-多基因混合遗传模型研究了P25的抗病遗传规律。结果表明:自交系P25的抗病基因为一主基因,表现为加性效应,没有检测出多基因,其在F2、B1和B2群体的遗传率分别为81.88%、38.14%和55.1%。利用SSR分子标记技术,以组合P25×F349的F2:3家系作为构图群体,构建了玉米SSR...
利用SSR标记分析玉米轮回选择群体的遗传多样性
玉米 轮回选择 遗传多样性 SSR
2008/2/1
摘要利用SSR标记技术分析了玉米基础群体DC0及其选择两轮后的群体HSC2和MSC2以及基础群体XFC0和其选择一轮后的群体XFC1的遗传多样性。结果表明:49对引物在5个玉米群体中共扩增出185个等位位点,每个SSR座位的等位基因数目为1~7个,平均为3.8个;基础群体多态性位点总数和多态性位点比例比其改良群体的略高; DC0、HSC2和MSC2 3个群体的基因平均杂合度相似,XFC0与XFC1...
我国西南地区玉米地方品种遗传多样性的SSR分子标记分析
遗传多样性 玉米地方品种 SSR标记
2008/1/24
摘要利用微卫星(SSR)标记技术和DNA混合取样方法,选取均匀覆盖玉米染色体组的42对SSR引物,检测了来自我国西南地区54个玉米地方品种的遗传多样性。在54个玉米地方品种中检测到256个等位基因,每个SSR标记的平均等位基因数为2-9,平均为6.1;根据遗传相似系数矩阵做出的树状图,将54个玉米地方品种大致划分成4类,来源于同一地区的多数玉米地方品种划分在同一类中。从54个玉米地方品种中选出11...
SSR分子标记检测出的花生类型内遗传变异
花生 SSR 遗传多样性 区别指数
2008/1/21
花生是我国重要的食用油和蛋白质来源作物, 鉴定其DNA分子多态性对品种改良和资源评价具有重要的意义。从已公布的花生Genomic-SSR和EST-SSR引物中筛选出34对引物, 用来分别鉴定花生4大类型各24份共96份品种资源的分子变异, 其中龙生型资源全部来自广西, 普通型资源中有11份从国外引进, 有13份来自广西和国内其他省市, 多粒型资源只有两份来自中国, 其他22份分别来自印度、美国和非...
开发SSR引物方法之研究动态Research Progress of Methods of SSR Primers Development
SSR标记 SSR引物 开发SSR引物 SSR引物的可转移性
2008/1/8
摘要
SSR标记是一种基于DNA长度多态性的分子标记技术,是进行群体遗传结构分析、构建遗传连锁图谱非常有效的工具。由于SSR标记是特异引物标记,必须在知道某个物种DNA序列的前提下,才能设计引物进行PCR扩增,故而存在一个引物开发的问题。从SSR标记的发展历程来看,开发SSR引物的方法有经典的构建与筛选基因组文库的方法、微卫星富集法、省略筛库法和数据库搜索法等四种。本文综述了这四种方法的操作流...
栓皮栎天然群体SSR遗传多样性研究Genetic Diversity of Microsatellites(SSRs)of Natural Populations of Quercus variabilis
栓皮栎 微卫星(SSR) 遗传多样性 遗传分化
2008/1/8
摘要
利用微卫星(SSR)标记对我国4个省内的5个栓皮栎(Quercus variabilis Bl.)天然群体的遗传多样性进行了研究。16对SSR标记揭示了栓皮栎丰富的遗传多样性:等位基因数(A)平均8.4375个,有效等位基因数(Ne)平均为5.9512个,平均期望杂合度(He)0.8059,Nei多样性指数(h)为0.8041。栓皮栎自然分布区中心地带的群体具有较高的遗传多样性,而人为对森...
我国陆地棉基础种质遗传多样性的SSR分子标记分析
基础种质 SSR 遗传多样性
2007/12/7
摘要利用398对BNL、JESPR 、TMB等SSR引物,对不同亲本来源、不同选育时期、不同种植生态区的43份陆地棉基础种质进行了遗传多样性的SSR分子标记分析。扩增产物用8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶检测,银染观察并照相。遗传多样性带型分析按位点多态信息量(PIC),Shannon-weaver多样性指数(H’)等方法,利用NTSYSpc2.1软件计算品种间的遗传相似系数(Jaccard系数),并用...