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山东省林业科学研究院专利:一种白蜡耐盐SSR分子标记、试剂及其应用
山东省林科院 白蜡 耐盐SSR 分子标记
2024/6/17
南京农业大学专利:一种基于转录组测序开发山茶属植物SSR引物的方法
南京农业大学 转录组测序 山茶属植物 SSR引物
2023/12/5
本发明提供一种基于转录组测序开发山茶属植物引物的方法:以茶树叶片为材料进行cDNA库的构建和illumina测序,经过滤和从头组装后获得转录组数据。使用MISA、SSR Hunter完成位点搜索,并对包含SSR位点的序列进行生物信息学分析。以此为据进行SSR分子标记引物的开发,利用开发的引物对部分山茶属植物材料进行遗传多样性分析。本发明成功设计38对引物,经多态性筛选最终获得16对多态性引物,利用...
南方红豆杉SSR 分布特征分析及分子标记的开发
南方红豆杉 GSS 序列 SSR 标记 频率
2013/9/9
利用基因组勘测序列(GSS 序列)探讨开发南方红豆杉(Taxus wallichiana var. mairei)SSR标记的可行性。从1 923 条GSS 序列中搜寻到184 个SSR 位点。其中二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸重复所占比例分别为88.6%、10.3%和1.1%。不同核苷酸在重复序列中的频率分析表明,a 和t 所出现的频率远远高于c 和g 的频率。对所获得的184 个SSR 位点设计...
SSR标记在甜瓜中的研究进展
SSR标记 甜瓜 研究进展
2011/9/28
SSR(simple sequence repeat)标记是建立在PCR基础上的一种新型DNA分子标记。由于SSR具有丰富的多态性,随机分布于甜瓜的整个基因组中,并表现为共显性,所以它是进行甜瓜遗传研究的理想工具。本文就SSR标记在甜瓜遗传多样性分析,构建遗传连锁图谱、标记和定位目的基因及标记辅助选择等方面的研究进展进行了综述。
Discrimination of Sugi (Cryptomeria japonica D. Don) Plus-tree Clones Using SSR Marker Analysis
clone discrimination discrimination power SSR marker sugi plus tree
2009/8/28
Eight hundred and thirty-five sugi (Cryptomerica japonica D. Don) plus-tree clones from the Kanto Breeding Region were genotyped using three highly polymorphic SSR markers. With a mean observed hetero...
橡胶树SAM-SSR体系的优化
橡胶树 SAM-SSR 优化
2009/7/20
以橡胶树品种热研88-13为试材,研究了橡胶树SAM-SSR法中各个过程(酶切、连接、抑制性和预扩增)中各因素对SAM法结果的影响。实验结果表明:5U MseⅠ和5U PstⅠ双酶切1h为最合适酶切浓度、方式和时间; 100~300ng为适宜的DNA模板浓度; 合适的连接温度和时间为16℃连接过夜;连接产物和抑制性PCR产物分别稀释20倍,为抑制性PCR和预扩增PCR的适宜模板浓度。 SAM扩增产...
以不同种源的鹅掌楸、北美鹅掌楸和不同组合的杂交鹅掌楸为试验材料,对176对SSR引物进行初筛、复筛,最后筛选出1对物种特异性SSR引物。该引物在鹅掌楸群体中特异性扩增出190 bp的产物,在北美鹅掌楸群体中特异性扩增出180 bp的产物,在杂交鹅掌楸群体中特异性扩增出180 bp和190 bp 2种产物。该引物对鹅掌楸种间鉴别准确率达100%。
与杨树木材密度、纤维性状相关的SSR分子标记
杨树 木材密度 纤维性状 SSR
2008/1/20
摘要通过对美洲黑杨(Populus deltoides)×青杨(P.catha yana)的68个F2、双亲及其4个F1无性系田间随机区组设计,5次重复,分析了与木材 材性有关的木材密度、纤维长、纤维宽以及微纤丝角等性状。结果表明:纤维长有明显的杂 种优势,控制该性状表现的基因之间具有正效应的互作;控制木材基本密度的基因之间具有 负效应的互作。结合SSR分子标记结果,采用单因素方差分析法进行标记与...
日本落叶松群体的叶绿体SSR分析Analysis of Genetic Structure in Population of Larix Kaempferi by Chloroplast SSR Markers
叶绿体微卫星 日本落叶松 单倍型 群体遗传结构
2008/1/8
摘要
利用叶绿体微卫星(cpSSR)分子标记对日本国内的7个日本落叶松(Larix kaempferi)群体遗传结构进行了研究。11对cpSSR引物中筛选出的3对多态性引物,共产生10个长度不同片段,在197个样品中组合出现10个不同的单倍型(haplotype)。各群体的单倍型差异较大。cpSSR基因座揭示了日本落叶松的遗传变异:平均等位基因数A=3.33,平均有效等位基因数NE=1.20,基...
1华中农业大学园林学院,武汉4300742中国科学院武汉植物园,武汉4300743信阳农业高等专科学校园艺林学系,河南信阳464000
摘要:本研究采用空间自相关分析方法对同域分布的中华猕猴桃(Actinidia chinensis)和美味猕猴桃(A. deliciosa)自然居群SSR遗传变异的空间结构进行了研究, 以探讨猕猴桃自然居群遗传变异的分布特征。选用的9对SSR引物在两物种中共扩增出...